Prezydium Samorządu Doktorantów jest organem reprezentującym społeczność doktorancką Akademii Marynarki Wojennej przed władzami Uczelni, a także na zewnątrz Akademii.
Obecnie Prezydium składa się z trzech członków:
Przewodnicząca – mgr Marika Sokół
Przewodnicząca komisji ds. kształcenia – mgr Jolanta Martuszewska
Przewodnicząca komisji ds. socjalno – bytowych: – mgr inż. Patrycja Jursza
Przedstawiciele Doktorantów w organach AMW
| Senat Akademii Marynarki Wojennej | mgr Marika Sokół |
| Uczelniana Komisja Dyscyplinarna ds. nauczycieli akademickich |
mgr Jolanta Martuszewska |
| Rada Wydziału Dowodzenia i Operacji Morskich | mgr Judyta Chajęcka |
| Komisja Wyborcza do Rady Wydziału | mgr Magdalena Kobylarz |
| Wydziałowy Zespół Jakości Kształcenia | mgr Witold Kortyka |
| Uczelniany Zespół Jakości Kształcenia | mgr Klaudia Skelnik |